学校创建于1956年，由上海第一医学院（现复旦大学上海医学院）分迁来渝组建，原名重庆医学院，1985年更名为重庆医科大学。学校是国务院学位委员会批准的首批具有博士和硕士学位授予权的单位，教育部批准的首批来华留学示范基地，2015年成为教育部、国家卫健委和重庆市人民政府共建高校。

学校由位于渝中区的袁家岗校区和位于重庆大学城的缙云校区组成，校园总面积2650亩。校园环境优美，风景如画。现有全日制在校学生27724人，其中博士生1601人，硕士生7249人，本科生18044人，专科生331人（支援少数民族项目），留学生499人。

学校现有8个一级学科博士学位授权点、13个一级学科硕士学位授权点，4个博士专业学位授权点、12个硕士专业学位授权点；4个国家重点学科，11个学科进入ESI全球前1%，其中临床医学学科进入ESI全球前1‰，2个重庆市一流学科，16个重庆市“十四五”市级重点学科。

重庆医科大学博士后流动站一级学科：公共卫生与预防医学、基础医学、生物学和药学。